linux下如何安裝Boost

如果是進行sequencing 相關的bioinformatic的人  多多少少會接觸到Illumina的資料

Illumina本身也有推出一套可以進行alignment的軟體  稱之為CASAVA

該軟體現階段更新至 version 1.8.2版本  而該軟體就需要用到Boost

這也是本人第一次遇到要安裝Boost

其實安裝boost這個C++函式庫的方式並不難,

但是對於一個linux新手來說還是會搞得一個頭兩個大

下面就是一步一步的用最精簡的方式完成boost的安裝

首先進入Boost網站中下載的頁面,選擇最新的Current Release

點入Download的頁面中,會有四種壓縮格式bz, 7z, zip及gzip, 我這邊使用gzip格式說明

首先進入LINUX中

1.首先下載檔案

wget http://sourceforge.net/projects/boost/files/boost/1.50.0/boost_1_50_0.tar.gz/download

2.解壓縮

tar -xzvf boost_1_50_0.tar.gz

3.進入解壓縮完的資料夾

cd  boost_1_50_0

4. 導出boost的編譯器

執行   ./bootstrap.sh

5. 進行編譯安裝(預設安裝在/usr/include)

./bjam " "-sTOOLS=gcc" "--includedir=/usr/include" "--libdir=/usr/lib/boost" install

接下來就完成了

如果有要使用ABySS這個程式進行de novo assembly

那boost也將是你必須安裝的程式